沁言学术科研论文 Skills 库
面向学术科研的综合性 Skills 集合库，为 AI Agent 提供 183 个学术研究 Skills，覆盖论文检索、科学写作、生物信息、药物发现、临床医学、机器学习、国家级基金申报等 18 个领域。支持一键安装、搜索、检测更新。
来源致谢
快速开始
一键安装（推荐）
# 安装全部 181 个 Skills（默认安装到 Claude Code）
curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/LeonChaoX/qinyan-academic-skills/main/install.sh | bash
按需安装
# 安装某个分类（按编号）
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -c 01 # 论文检索与文献管理
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -c 05 # 生物信息与基因组学
# 安装单个 Skill
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -s scanpy
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -s paper-slide-deck
# 安装沁言学术 Skills
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -s qinyan-paper-search
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- -s qinyan-paper-analysis
以上命令中 .../install.sh 为 https://raw.githubusercontent.com/LeonChaoX/qinyan-academic-skills/main/install.sh 的缩写。
指定工具 & 作用域
# 安装到不同工具
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --tool cursor
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --tool codex
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --tool gemini
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --tool openclaw
# 安装到当前项目（而非全局）
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --project
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --project -s scanpy
搜索与浏览
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --list # 列出所有分类
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --list-skills # 列出全部 Skills
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --search 蛋白质 # 搜索 Skills
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --search drug
检测更新 & 版本管理
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --check-update # 检查是否有新版本
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --update # 更新全部
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --update -s scanpy # 更新单个
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --update --force # 强制更新（覆盖本地修改）
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --status # 查看已安装状态
curl -fsSL .../install.sh | bash -s -- --version # 查看脚本版本
Git Clone 安装
git clone https://github.com/LeonChaoX/qinyan-academic-skills.git
cd qinyan-academic-skills
bash install.sh # 安装全部
bash install.sh -s scanpy # 安装单个
bash install.sh -c 05 # 安装分类
bash install.sh --search 论文 # 搜索
bash install.sh --check-update # 检查更新
bash install.sh --update # 更新
bash install.sh --help # 查看帮助
支持的工具
| 工具 |
--tool 参数 |
全局安装目录 |
项目级安装目录 |
| Claude Code |
claude（默认） |
~/.claude/skills/ |
.claude/skills/ |
| Cursor |
cursor |
~/.cursor/skills/ |
.cursor/skills/ |
| Codex |
codex |
~/.codex/skills/ |
.codex/skills/ |
| Gemini CLI |
gemini |
~/.gemini/skills/ |
.gemini/skills/ |
| OpenClaw |
openclaw |
~/.openclaw/skills/ |
.openclaw/skills/ |
Skills 分类目录
总计：183 个 Skills，18 个分类
Skills 详细列表
沁言学术 Skills
沁言学术自研的 Skills，通过沁言学术 OpenAPI 提供论文搜索、分析、润色等能力。
| Skill |
说明 |
| qinyan-paper-search |
沁言学术论文搜索（Google Scholar/PubMed/ArXiv/万方） |
| qinyan-paper-analysis |
沁言学术论文深度分析解读 |
| qinyan-paper-polish |
沁言学术论文润色与改写 |
| qinyan-citation |
沁言学术引文搜索 |
| qinyan-topic-analysis |
沁言学术研究主题分析 |
01-论文检索与文献管理
| Skill |
说明 |
| bgpt-paper-search |
结构化全文论文搜索（方法、结果、样本量等25+字段） |
| biorxiv-database |
bioRxiv 预印本数据库 |
| citation-management |
引用管理工具 |
| literature-review |
文献综述撰写 |
| openalex-database |
OpenAlex 学术文献数据库 |
| parallel-web |
并行网络搜索与摘要生成 |
| perplexity-search |
AI驱动的实时信息搜索 |
| pubmed-database |
PubMed 生物医学文献数据库 |
| pyzotero |
Zotero 文献管理Python接口 |
| research-lookup |
研究发现工具 |
02-科学写作与学术交流
| Skill |
说明 |
| medical-imaging-review |
医学影像AI综述写作（7阶段系统化工作流） |
| paper-2-web |
论文转网页发布 |
| peer-review |
同行评审工具 |
| research-proposal |
PhD研究计划撰写（支持中英文，Nature Reviews学术写作风格） |
| scientific-writing |
科学论文写作 |
| venue-templates |
学术会议/期刊模板 |
03-学术演示与可视化
| Skill |
说明 |
| generate-image |
AI图像生成（FLUX.2 Pro） |
| infographics |
专业信息图表制作（10类型，8风格） |
| latex-posters |
LaTeX学术海报 |
| markdown-mermaid-writing |
Mermaid流程图与文档 |
| paper-slide-deck |
论文自动生成演示文稿（17种视觉风格，自动提取图表） |
| pptx-posters |
PPTX学术海报 |
| scientific-schematics |
科学示意图绘制 |
| scientific-slides |
科学报告幻灯片 |
| scientific-visualization |
科学数据可视化 |
04-研究方法与科学思维
| Skill |
说明 |
| consciousness-council |
多视角专家讨论与分析 |
| dhdna-profiler |
认知模式与思维特征分析 |
| hypothesis-generation |
科学假设生成 |
| nsfc-proposal |
国家自然科学基金（NSFC）申请书撰写（青基/优青/杰青，2026版规范） |
| nssfc-proposal |
国家社会科学基金（NSSFC）年度项目申请书撰写（重点/一般/青年/西部，2025版规范，含活页匿名化） |
| research-grants |
基金申请写作（NSF/NIH/DOE/DARPA/NSTC 海外基金） |
| scholar-evaluation |
学者评估 |
| scientific-brainstorming |
科学头脑风暴 |
| scientific-critical-thinking |
科学批判性思维 |
| what-if-oracle |
多分支可能性探索与风险分析 |
05-生物信息与基因组学
| Skill |
说明 |
| anndata |
单细胞数据结构 |
| arboreto |
基因调控网络推断 |
| biopython |
生物序列分析 |
| bioservices |
生物信息Web服务（40+数据源） |
| cellxgene-census |
单细胞数据集 |
| deeptools |
深度测序分析 |
| etetoolkit |
进化树分析 |
| flowio |
流式细胞术数据处理 |
| geniml |
基因组机器学习 |
| gget |
基因组数据获取（20+数据库） |
| gtars |
基因组区域分析 |
| lamindb |
生物数据管理 |
| phylogenetics |
系统发育分析 |
| pydeseq2 |
差异表达分析 |
| pysam |
SAM/BAM文件处理 |
| scanpy |
单细胞RNA-seq分析 |
| scikit-bio |
生物信息统计 |
| scvelo |
RNA速率分析 |
| scvi-tools |
单细胞变分推断 |
| tiledbvcf |
VCF变异数据库管理 |
| zarr-python |
大规模数组存储 |
06-化学信息与药物发现
| Skill |
说明 |
| datamol |
分子数据处理 |
| deepchem |
药物发现深度学习 |
| diffdock |
分子对接预测 |
| matchms |
质谱匹配 |
| medchem |
药物化学分析 |
| molecular-dynamics |
分子动力学模拟 |
| molfeat |
分子特征提取 |
| pyopenms |
质谱数据处理 |
| pytdc |
药物发现基准测试 |
| rdkit |
化学信息学工具包 |
| rowan |
云端量子化学计算 |
| torchdrug |
药物发现图神经网络 |
07-临床医学与精准医疗
| Skill |
说明 |
| cbioportal-database |
癌症基因组数据库 |
| clinical-decision-support |
临床决策支持 |
| clinical-reports |
临床报告生成 |
| clinicaltrials-database |
临床试验数据库 |
| clinpgx-database |
药物基因组学数据库 |
| clinvar-database |
变异致病性数据库 |
| cosmic-database |
癌症体细胞突变数据库 |
| depmap |
癌细胞系依赖性数据 |
| fda-database |
FDA药物数据库 |
| histolab |
组织病理学分析 |
| imaging-data-commons |
医学影像数据库 |
| monarch-database |
罕见病数据库 |
| neurokit2 |
生理信号处理 |
| neuropixels-analysis |
神经电生理分析 |
| pathml |
数字病理学 |
| pydicom |
DICOM影像处理 |
| pyhealth |
健康AI工具 |
| treatment-plans |
治疗方案设计 |
08-蛋白质工程与结构生物学
| Skill |
说明 |
| adaptyv |
蛋白质自动化测试平台 |
| alphafold-database |
AlphaFold蛋白质结构数据库 |
| esm |
蛋白质语言模型 |
| glycoengineering |
糖基化工程 |
| interpro-database |
蛋白质结构域数据库 |
| pdb-database |
蛋白质结构数据库 |
| uniprot-database |
蛋白质序列数据库 |
09-机器学习与人工智能
| Skill |
说明 |
| aeon |
时间序列分析 |
| hypogenic |
假设驱动的AI |
| pymc |
贝叶斯统计建模 |
| pymoo |
多目标优化 |
| pufferlib |
强化学习 |
| pytorch-lightning |
PyTorch训练框架 |
| scikit-learn |
经典机器学习 |
| scikit-survival |
生存分析 |
| shap |
模型可解释性 |
| stable-baselines3 |
强化学习算法 |
| timesfm-forecasting |
时间序列预测（Google零样本模型） |
| torch-geometric |
图神经网络 |
| transformers |
Transformer模型 |
| umap-learn |
降维可视化 |
10-材料科学与物理计算
| Skill |
说明 |
| astropy |
天文学计算 |
| cirq |
Google量子电路 |
| cobrapy |
代谢建模 |
| fluidsim |
计算流体力学 |
| matlab |
MATLAB/Octave数值计算 |
| pennylane |
量子机器学习 |
| pymatgen |
材料科学分析 |
| qiskit |
IBM量子计算 |
| qutip |
量子系统模拟 |
| simpy |
离散事件仿真 |
11-数据分析与统计建模
| Skill |
说明 |
| dask |
分布式计算 |
| exploratory-data-analysis |
探索性数据分析 |
| matplotlib |
绘图库 |
| networkx |
网络/图分析 |
| plotly |
交互式可视化 |
| polars |
高性能数据框 |
| seaborn |
统计数据可视化 |
| statistical-analysis |
统计分析工作流 |
| statsmodels |
统计建模 |
| sympy |
符号数学计算 |
| vaex |
大数据懒计算 |
12-科学数据库
| Skill |
说明 |
| bindingdb-database |
药物-靶标结合亲和力 |
| brenda-database |
酶学数据库 |
| chembl-database |
生物活性分子数据库 |
| datacommons-client |
Google数据公共资源 |
| drugbank-database |
药物信息数据库 |
| ena-database |
欧洲核酸数据库 |
| ensembl-database |
基因组注释数据库 |
| gene-database |
NCBI基因数据库 |
| geo-database |
基因表达数据库 |
| gnomad-database |
群体等位基因频率 |
| gtex-database |
组织特异性表达 |
| gwas-database |
全基因组关联研究 |
| hmdb-database |
人类代谢组数据库 |
| jaspar-database |
转录因子结合位点 |
| kegg-database |
通路与基因组数据库 |
| metabolomics-workbench-database |
代谢组学数据库 |
| opentargets-database |
药物靶标数据库 |
| pubchem-database |
化学分子数据库 |
| reactome-database |
生物通路数据库 |
| string-database |
蛋白质互作网络 |
| uspto-database |
美国专利数据库 |
| zinc-database |
可购买化合物数据库 |
13-实验室自动化与集成
| Skill |
说明 |
| benchling-integration |
Benchling实验室平台 |
| dnanexus-integration |
DNAnexus基因组分析平台 |
| ginkgo-cloud-lab |
合成生物学云实验室 |
| labarchive-integration |
LabArchives电子实验记录 |
| latchbio-integration |
LatchBio生物信息平台 |
| omero-integration |
显微镜影像管理 |
| opentrons-integration |
Opentrons液体处理 |
| protocolsio-integration |
Protocols.io实验方案 |
| pylabrobot |
Python实验室机器人 |
14-文档处理与数据工具
| Skill |
说明 |
| denario |
研究数据分析流水线 |
| docx |
Word文档处理 |
| markitdown |
文件格式转Markdown |
| open-notebook |
开源NotebookLM替代方案 |
| pdf |
PDF文档处理 |
| pptx |
PowerPoint处理 |
| xlsx |
Excel表格处理 |
15-金融与经济数据
| Skill |
说明 |
| alpha-vantage |
全球市场数据（股票/外汇/加密货币） |
| edgartools |
SEC财务数据 |
| fred-economic-data |
美联储经济数据（80万+时间序列） |
| hedgefundmonitor |
对冲基金系统性风险监控 |
| market-research-reports |
市场研究报告 |
| usfiscaldata |
美国联邦财政数据 |
16-地理空间与遥感
| Skill |
说明 |
| geopandas |
地理空间数据分析 |
| geomaster |
遥感/GIS/卫星影像/空间ML（500+示例） |
17-平台与基础设施
| Skill |
说明 |
| get-available-resources |
可用资源检测 |
| iso-13485-certification |
医疗器械ISO认证 |
| modal |
Modal云计算平台 |
| offer-k-dense-web |
K-Dense Web平台 |
技术文档
详见 docs/technical-guide.md，包含搜索、检测更新、更新机制的完整技术原理。
贡献
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MIT License - 详见 LICENSE 文件
每个 Skill 可能有自己的许可证，详见各 Skill 的 SKILL.md 中的 license 字段。